Formations à Epi - Info

Mardi 9 janvier 2007

Les supports de formation en ligne

bullet Le logiciel Epi INFO
bullet Le CD-Rom Module de formation à l'épidémiologie analytique
 

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Au delà de sa stratégie d'approche et de ses objectifs sectoriels, le Réseau océanien de surveillance de la santé publique a pour but de contribuer au développement social et économique des sociétés océaniennes. Pour nous, la mise en réseau doit renforcer le potentiel du développement local, en améliorant l'intégration des ressources nécessaires au niveau régional, et ce faisant, en assurant de meilleures fondations pour un développement durable.

De plus, la mise en réseau répond à une requête émanant des pays et territoires océaniens : c'est-à-dire la création d'un groupe régional d'experts en santé publique, qui permette aux professionnels de la santé océaniens de s'entraider sans avoir nécessairement recours aux organisations régionales ou internationales, comme la CPS ou l'OMS.

Ce sont ces mêmes principes qui ont guidés l'élaboration des cours de formation et la sélection des méthodes et des supports de formation utilisés.

Le logiciel Epi INFO 6

Epi INFO est un logiciel de traitement de texte, de bases de données et de statistiques appliqué à l'épidémiologie. Le programme a été conçu par le Bureau du programme d'épidémiologie des Centres de lutte et de prévention des maladies (CDC) et par le Programme mondial de lutte contre le sida de l'OMS. Il est accessible par toute la communauté des personnes travaillant en santé publique.

On peut télécharger le logiciel Epi INFO à partir d'Internet :

bullet au site de l'Ecole Nationale de Santé publique en France (http://www.ensp.fr/services/logiciels/epiinfo_604d_fr.htm)
bullet au site du CDC américain (http://www.cdc.gov/epiinfo/Epi6/ei6.htm).

Par ailleurs, une liste de discussion est disponible pour aider les utilisateurs d'Epi INFO à résoudre les problèmes rencontrés. Pour s'inscrire à cette liste, envoyer le message 'subscribe epi-info' sans corps de texte, ni sujet, ni signature à l'adresse suivante : listserv@listserv.cdc.gov.

Le logiciel Epi INFO permet d'organiser les données épidémiologiques sous la forme d'un questionnaire, et de présenter les objectifs d'une étude et les résultats obtenus sous un format utilisable dans les rapports écrits. Ainsi, on peutnon seulement créer et traiter un formulaire en quelques minutes, mais aussi utiliser Epi INFO pour établir une puissante base de données pour la surveillance des maladies, avec de nombreux fichiers et différents types de relevés. Epi INFO comporte les fonctions les plus fréquemment utilisées par les épidémiologistes dans les programmes de statistiques, comme SAS ou SPSS, ou dans des logiciels de bases de données comme dBASE. Ces fonctions sont associées à un système simple qui peut être copié sans droit et transmis à des collègues.

Trois niveaux d'exploitation

Il y a trois niveaux d'exploitation du logiciel Epi INFO pour le traitement d'un questionnaire ou d'autres données structurées. En utilisant ce programme au niveau le plus simple, on peut mettre en place un questionnaire ou un formulaire d'enquête sur ordinateur en quelques minutes. Il suffit de :

bullet lancer le menu principal;
bullet taper le formulaire à l'aide de la fonction EPED, d'un traitement de texte ou d'autres logiciels de textes;
bullet entrer les données dans le questionnaire en utilisant la fonction ENTER;
bullet analyser les données avec la fonction ANALYSIS pour produire des listes, obtenir des fréquences, des tabulations croisées, des moyennes, des graphes et les statistiques correspondantes.

Au fur et à mesure que la maîtrise du logiciel augmente, vous pourrez utiliser d'autres outils pour structurer les entrées de données et analyser vos besoins. Sans doute voudriez-vous par exemple :

bullet inserrer un correcteur d'erreurs, des options de saut, un codage automatique dans le questionnaire grâce à la fonction CHECK;
bullet sélectionner des enregistrements, créer de nouvelles variables, recoder des variables, manipuler les dates et entreprendre des opérations conditionnelles avec l'option IF activée durant la fonction ANALYSIS;
bullet incorporer ces opérations dans des fichiers de programmation de façon à ce qu'elles soient réalisées de façon réppétées ou par des personnes qui ne savent pas programmer; ou
bullet importer ou exporter ces fichiers d'autres systèmes comme SAS, SPSS, dBASE et Lotus.

Le troisième niveau d'exploitation est important pour la mise en place d'un système de bases de données, pour une grande étude épidémiologique ou si vous souhaitez adapter les opérations d'Epi INFO à des besoins spécifiques. Pour cela, vous pourrez :

bullet programmer la saisie des données pour inclure des opérations mathématiques, des vérifications logiques, des changements de couleurs, des boîtes de dialogues, etc...
bullet préciser le format des rapports obtenus avec ANALYSIS pour produire des tableaux personnalisés;
bullet entrer des données dans plus d'un fichier lors d'une même session, vous déplaçant automatiquement d'un questionnaire à l'autre avec ENTER;
bullet lier différents types de fichiers entre eux avec ANALYSIS, de façon à pouvoir répondre à des questions qui impliquent plus d'un fichier;
bullet comparer les copies de fichiers saisies par différents opérateurs pour détecter des erreurs de saisie.

 

trianglyll.gif (913 bytes) Nouveau - CD-Rom

Troisième module de formation 

à l'épidémiologie analytique

Téléchargeable à partir de ce site

Par Marc
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Mardi 9 janvier 2007

>> Téléchargeable à partir de ce site !  >> copies disponibles sur demande pour les membres du ROSSP

Compilé par le Dr Kevin Carroll, MBBS, MSc, MPH, MFPHMI 

Spécialiste de santé publique

, détaché par le Royaume-Uni auprès de la section Surveillance de la santé publique et lutte contre les maladies transmissibles de la CPS

La section Surveillance de la santé publique et lutte contre les maladies transmissibles de la CPS avait déjà élaboré deux modules de formation – niveau 1, "élémentaire" et niveau 2, "avancé" – en surveillance de la santé publique et à l'utilisation du logiciel EpiInfo 6 pour le compte du ROSSP. Un grand nombre de praticiens de santé publique de tout le Pacifique ont participé à ces actions de formation, les ont appréciées et en ont tiré profit sur le plan professionnel.

 

Pour parachever le programme de formation, nous avons mis au point un module sur l'utilisation de l'épidémiologie analytique pour les investigations et la lutte contre les épidémies. Le module a été conçu compte tenu des notions présentées dans le rapport intitulé "Formation en santé publique axée sur la pratique professionnelle[1]". Il amène l'étudiant à franchir l'une après l'autres les étapes de la lutte contre une flambée épidémique d'une manière qui lui fait croire qu'il est "dans le feu de l'action". Il complète les deux premiers modules et rappelle en renforçant bon nombre des notions présentées précédemment. Pour qu'il soit plus adapté à la région, le scénario évoque une épidémie de choléra dans une île du Pacifique, ce qui permet à l'étudiant non seulement de se familiariser avec l'épidémiologie analytique mais aussi avec l'épidémiologie du choléra et les mesures de prévention et de lutte à prendre dans le contexte particulier du Pacifique.

 

Ce troisième module est un exemple d'apprentissage assisté par ordinateur. Son temps fort est un exercice que les étudiants peuvent faire en petits groupes sous la conduite d'un moniteur, ou individuellement. Cet exercice a été mis au point à l'aide du progiciel DOEPI disponible sur EpiInfo. L'un des grands avantages qu'offre cet outil est qu'il est totalement intégré à EpiInfo. Il permet ainsi d'élaborer un exercice véritablement interactif donnant à l'étudiant la possibilité de créer des questionnaires EpiInfo, de vérifier des dossiers, de manipuler des données et de réaliser des analyses à partir de cet exercice. À mesure qu'ils avancent dans l'exercice, les étudiants ont accès à des ressources grâce à des liens qui leur ouvrent des documents et des communications. L'analyse de données issues d'une véritable épidémie est une partie capitale de l'exercice, grâce à EpiInfo 6.

 

Dans la première partie de l'exercice, l'étudiant fait des analyses descriptives des données émanant de l'hôpital et du dispensaire ou de la collectivité – ce qui lui permet de réviser les connaissances acquises dans le cadre du deuxième module "avancé". Dans la deuxième partie, il planifie une étude analytique et analyse les données issues d'une véritable enquête. Il interprète les données et recommande des actions de santé publique. Grâce à des liens avec des documents clés – monographies, rapports de l'OMS et notes sur les divers concepts de l'épidémiologie et de la statistique médicale – abordés dans le module, l'étudiant a accès à des références et à des informations générales.

 

Après avoir terminé la première partie de l'exercice, l'étudiant devrait être en mesure de :

 

1.      décrire des données épidémiologiques selon le moment, l'endroit et les caractéristiques des patients;

 

2.      évaluer l'incidence et le taux d'incidence et savoir comment et quand les calculer;

 

3.      utiliser les commandes d'EpiInfo pour importer, visualiser, analyser et réaliser des graphiques à partir de données;

 

4.      comprendre les différentes étapes de la gestion d'une épidémie;

 

5.      être capable de traduire des données descriptives en informations et de les interpréter en vue d'engager une action de santé publique.

 

Après avoir terminé la deuxième partie de l'exercice, l'étudiant devrait être capable de :

 

1.      décider du moment où une étude épidémiologique analytique est utile;

 

2.      distinguer les avantages et les inconvénients de différents types d'étude et choisir celui qui convient;

 

3.      calculer la taille de l'échantillon d'une étude, en ayant recours à STATCALC dans EpiInfo;

 

4.      élaborer un protocole d'étude et préparer des questionnaires écrits;

 

5.      saisir la différence entre des modèles appariés et d'autres qui ne le sont pas, et savoir quand les utiliser;

 

6.      comprendre les notions statistiques de biais, de confusion, de modification d'effets et d'interaction;

 

7.      réaliser des analyses appropriées et comprendre la nécessité d'effectuer des tests d'hypothèses statistiques;

 

8.      réaliser une analyse élémentaire de régression logistique;

 

9.      interpréter correctement les résultats des analyses;

 

10.    faire montre d'une bonne connaissance des principales caractéristiques épidémiologiques du choléra;

 

11.    faire montre d'une bonne connaissance des mesures à prendre pour prévenir les épidémies de choléra dans les États et territoires océaniens, et pour les enrayer quand elles se sont déclarées.

 

Outre le module lui-même, une application informatisée sous Windows a également été élaborée dans le cadre du ROSSP, pour permettre aux éducateurs sanitaires de réaliser plus facilement des exercices adaptés aux besoins des praticiens en santé publique dans le Pacifique, au moyen de DOEPI. Cette application a aussi facilité l'adaptation de ces modules de formation pour l'apprentissage à distance par le Web.

Par Marc
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